Äärimmäisen karkea ja epäkypsä idea COVID-19: stä = Wuhanin merenelävien markkinoista keuhkokuumevirus (1) tiivistelmä

(Vastuuvapauslauseke: Minulla ei ehkä ole tarpeeksi aikaa valmistella koko raporttia, ja loppuosa siitä ei myöskään ole keskisuuria. En ole virologi ja tämä perustuu vain data-analyysiin. Arvostan asiantuntijoiden apua ja ehdotuksia.)

Vertaamalla Wuhan-merenelävien markkinoiden keuhkokuumevirus-isolaatin koko genomin ja piikkiproteiinisekvenssin Wuhan-Hu-1 (NCBI-referenssisekvenssi: NC_045512.2; Wuhan-virus) ja lepakoiden koronavirusisolaatin RaTG13 (GenBank: MN996532.1; raporttia, että ihminen ei ollut) tartunnan tämän viruksen; RaTG13), joka on virus, jolla on korkein identiteetti, ilmoitin kolme kiehtovaa ilmiötä:

1. Määritellään koronaviruksen, erityisesti SARSiin liittyvän koronaviruksen, aikaisemman tutkimuksen perusta, kaksi alayksikköä (S1 ja S2), reseptoria sitova domeeni (RBD) ja reseptoria sitova motiivi (RBM). Eroisuuden runsaus (RBM> RBD> S1> S2) korreloi domeenin merkityksen kanssa koronaviruksen ja ihmisen ACE2-reseptorin välisessä sitoutumisessa.

2. On 15 aminohappoa, joiden on ilmoitettu olevan suorassa vuorovaikutuksessa ihmisen ACE2-reseptorin kanssa. Niitä on kuusi (ottaen huomioon 97%: n identiteetti koko aminosekvenssin välillä) Wuhan-viruksen ja RaTG13: n välillä. Kaikki kuusi aminohappoa ovat vuorovaikutteisia Wuhan-viruksessa, mutta eivät RaTG13: ssa. Konservatiivisten aminohappojen joukossa 8 niistä on interaktiivisia. 15: n joukossa on myös 5 kiistanalaista tärkeää aminohappoa. 4: stä näyttävät sitten erot, kun taas viimeinen yllättävän on ainoa 15: stä, joita ei pidetä interaktiivisina.

3. Wuhan-viruksen S1 ja S2-alayksikön välillä on 12 emäsparin motiivi, joka on ainutlaatuinen, ja analysoimalla tätä motiivia välillä -3 - +15, löydän yhden restriktiopaikan Bsp1286 I (Sdu I).

Näiden kolmen ilmiön lisätutkimukset voivat antaa lisätietoja Wuhan-viruksen alkuperästä ja patogeenisyydestä.